El Perú tiene una superficie de 1.285.216 km², incluyendo el territorio de las islas ubicadas en la parte peruana del Oceáno Pacífico y también las del lago Titicaca. Además tiene soberanía sobre parte del continente antártico y jurisdicción sobre una franja de 200 millas (370 km) del Oceáno Pacífico, lo que representa una extensión de aproximadamente 0,9 millones de km² y. (143)

1. Relieve

2. Clima

3. Flora y Fauna

1. Relieve

El Perú es considerado como un país megadiverso.En tan sólo 1 % de la superficie continental del planeta, concentra a cercade 11 % de las especies de interés económico y científico existentes en el mundo. Esta riqueza se debe principalmente a la heterogeneidad geográfica del país (83). En efecto, el relieve del territorio nacional se caracteriza por cambios abruptos y en ciertas zonas es muy accidentado debido a la interacción de procesos geológicos y tectónicos. El sistema montañoso de la Cordillera de los Andes lo atraviesa longitudinalmente, en dirección Noroeste-Sureste. El elemento orográfico más notable de este sistema es la Cadena Occidental, porque además de su manifiesta definición y continuidad en su desarrollo, su línea de cumbres marca la divisora continental de las aguas.

La Cordillera origina tres unidades geográficas longitudinales de notables contrastes geomorfológicos y climáticos : una desértica franja costera, que constituye el 10% del territorio peruano y alberga al 53% de su población; una amplia región montañosa con abundantes picos, valles y mesetas llamada la sierra andina que ocupa el 30% del territorio y alberga al 35% de la población; finalmente, la región selvática amazónica que cubre el 60% del territorio peruano y donde vive sólo el 12% de su población. Estas regiones, comúnmente llamada Costa, Sierra y Selva, determinan tres cuencas hidrográficas : Pacífico, Amazonas y Titicaca. (143)

2. Clima

Dada su posición en el Pacífico, el Perú es el punto de encuentro de dos importantes corrientes oceánicas : la corriente de Humboldt, proveniente del Antártico, y la de El Niño llegada desde las cálidas regiones ecuatoriales.

Es posible distinguir dos estaciones en el clima del Perú : la estación lluviosa y la estación seca ; aunque su aparición varía con respecto a la región. La Costa y los Andes occidentales generalmente son secos. La Costa norte es más cálida y la Costa sur posee un clima más templado. En los Andes la estación seca va de mayo a septiembre ; a mayor altitud la temperatura va disminuyendo, llegando a valores de congelación por encima de los 3000 msnm. Los amplios territorios de la selva, por su parte, presentan un clima tropical húmedo y muy húmedo.

3. Flora

El Perú es un país complejo fisiográfica y ecológicamente. La configuración semejante a islas de las cumbres de montañas aisladas pueden haber provisto condiciones para competencia reducida, en la cual poblaciones relicto persistieron y se diferenciaron. Esto ha llevado a altos niveles de endemismo. (81)

Es el quinto país en el mundo en número de especies ; primero en número de especies de plantas de propiedades conocidas y utilizadas por el hombre (4.400) y primero en especies domesticadas nativas (128). Se calcula que en el territorio nacional existen unas 25.000 especies de plantas (10 % del total mundial), de las cuales más del 20 % son endémicas (5.528). (73)

La cobertura vegetal del es muy diversificada a lo largo del territorio. En las lomas de la Costa se registra la presencia de vegetaciones estacionales que se limitan a los meses de presencia de lluvias, tales como las lomas de Atiquipa en Arequipa, las lomas de Pachacamac y Lachay cerca de Lima. La Sierra registra la presencia de malezas, cactus y pequeñas plantas resistentes a la sequía, conformando las más importantes praderas naturales del país. La vegetación de la Selva está representada por los bosques tropicales amazónicos, donde alternan los árboles de madera dura con la presencia de palmeras y plantas epífitas.

Mucho del carácter único de la flora y fauna peruana está concentrado en las vertientes orientales y occidentales de la cordillera de los Andes, en los denominados bosques montanos. Si bien las comunidades de la Amazonía son taxonómicamente las más ricas, muchas de las especies tienen amplia distribución. En los bosques montanos, por el contrario, las barreras biogeográficas, resultantes de la acción erosiva de los ríos y la compleja topografía de la cordillera oriental han favorecido la evolución de endemismos en numerosos grupos de plantas y animales, con distribuciones restringidas a la pendiente del terreno, un cierto rango altitudinal y otros factores. Su estado natural de fragmentación los ubica como componentes de la diversidad biológica extremadamente vulnerables a las actividades humanas. (143) 

4. Fauna

En lo referente a la fauna, es el primer país del mundo en cuanto a diversidad de peces (2.000 especies, representando 10 % del total mundial), el segundo en aves (1.730 especies), el tercero en anfibios (330 especies) y el tercero en mamíferos (462 especies) ; de estas especies se estima que 760 son endémicas.

Contrastando fuertemente con las otras regiones del país, la Costa es pobre en especies, destacando el venado, la iguana, el zorrillo y la tortuga gigante. Los ríos registran una diversidad apreciable de peces, siendo particularmente abundantes los camarones. La Sierra se caracteriza por la presencia de alpacas y vicuñas, pero se registran también venados, chinchillas y vizcachas. En los lagos se tiene aves como las gaviotas, parihuanas, patillos y zambullidoras. La Selva, por ende, tiene una fauna bastante diversificada, destacando la presencia del jaguar, grandes serpientes, cocodrilos, jabalíes, papagallos, loros y otras aves. Quizás la diversidad más fascinante se encuentra en el mundo invertebrado, aún muy desconocido, excepto en sitios puntuales donde se han concentrado las investigaciones.

En la Reserva Natural Tambopata-Candamo (Madre de Dios), por ejemplo, frecuentemente referida como la capital biológica del mundo, se registraron 5.000 especies de insectos en la copa de un solo arból, entre las cuales 500 escarabajos y 80 especies de hormiguas. Un inventario realizado en un área de 550 ha en la misma zona 90 especies de mamíferos, 570 aves, 127 reptiles y anfíbios, 1.207 mariposas, 40 termitas, 29 libélulas, 600 coleópteros, 73 39 especies de abejas. (83)

En los ríos viven caimanes y tortugas, en tanto que el mar peruano destaca por la abundancia de de corvinas, lenguados, anchoveta, bonito, crustáceos y mariscos. Además se encuentran tiburones, cachalotes y ballenas.